《巴蜀全书》是国家社科基金重大委托项目（ZH@005）、四川省委常委会批准的重大文化工程（川宣【2012】110号），主要对现今四川省、重庆市的历史文献进行调查、整理和研究。对历史上巴蜀文献的存佚状况进行调查研究，编制巴蜀文献联合目录，精心校勘、注释和评论巴蜀文献，考察和再造巴蜀善本文献，实现了巴蜀文献有史以来规模最大、体例最新、使用最方便的编录和出版，打造了巴蜀文化的“四库全书”。项目最终成果形式为巴蜀地方文献大型丛书，分巴蜀文献联合目录、巴蜀文献精品集萃、巴蜀文献珍本善本三个系列，成书610余种，约1.5亿字。已出成果《宋会要辑稿》《廖平全集》等曾获教育部优秀成果一等奖、四川省政府优秀成果一等奖、全国古籍整理优秀成果奖等多项。2023年3月，《巴蜀全书》通过国家社科基金结项验收审批，结项等级为“优秀”。